1.2011年学期伊始，院领导班子向学校汇报学院“十二五”发展规划，在认真听取意见的基础上进行了修改，最终形成学院“十二五”发展规划。
2.药学一级学科博士学位授权资格已通过国务院学位办评审。学院获校“十一五”期间学科建设进步奖。
3.获得国家自然基金7项、省级科研项目7项，总经费达700万元。全院发表SCI论文23篇，申请专利7项。
| 序号 | 项目类别 | 项目名称 | 负责人 | 经费（万元） |
| 1 | 江苏省自然科学基金重点研究专项 | nNOS介导的蛋白-蛋白相互作用与脑损伤再生修复 | 朱东亚 | 300 |
| 2 | 国家自然科学基金 面上项目 | 基于量子点表面分子印迹技术的多通道快速测定神经递质研究 | 胡 琴 | 60 |
| 3 | 国家自然科学基金 面上项目 | 功能纳米硅胶表面高效率分子印记可控自组装体系构建及应用研究 | 周学敏 | 60 |
| 4 | 国家自然科学基金 面上项目 | 基于质谱的定向蛋白组学对细胞因子和肿瘤多药耐药相关性的研究 | 陈 芸 | 60 |
| 5 | 国家自然科学基金 面上项目 | nNOS-PSD-95解偶联剂的设计、合成及生物活性研究 | 李 飞 | 60 |
| 6 | 国家自然科学基金 面上项目 | 新型介孔分子筛表面分子印记聚合物的研制及其在中药代谢物研究中的应用 | 陈立娜 | 58 |
| 7 | 国家自然科学基金 青年基金 | 快速单细胞胆固醇电分析平台的建立及其在斯达汀类药物开发中的应用 | 方丹君 | 25 |
| 8 | 国家自然科学基金 青年基金 | 麦胚凝集素修饰的固体脂质纳米粒递送NR2B9c经鼻入脑治疗缺血性脑卒中的实验研究 | 李 瑞 | 21 |
4.朱东亚教授课题组与先声药业签署战略合作协议，共同研发抗脑卒中创新药物。
5.胡琴教授获校第五届“扬子江奖教金”，许贯虹老师获校第三届 “青年教师奖教金”。《分析化学》课程获南京医科大学第六批精品课程立项资助，《医学基础化学》教学网站获南京医科大学优秀多媒体教学课件二等奖。
6.我院2011届毕业生中有83人获学士学位，14人获硕士学位，1人获博士学位。本科毕业生中，有19人保送或考取硕士研究生，其中1人考取北京大学硕士研究生。1名硕士毕业生考取英国牛津大学博士研究生。
7.我院学生参加“2011年全国医药院校药学/中药学专业大学生实验技能竞赛”，获一、二等奖各1项。
8.院党委组织开展“践行师德，创先争优”主题实践系列活动，全院各党支部及党员教师结合岗位职责做出公开承诺。
9.院党委深入开展“党旗飘飘”主题实践活动，庆祝建党九十周年。化学系党支部、研究生党支部开展“环境激素与我们的健康”科普宣传活动，药学综合实验室党支部开展“合理用药，关注健康，服务社区”服务社区活动，获得校最佳党日活动评比三等奖。
10.院党委不断创新载体和途径，积极推进学院和谐文化的建设，学院凝聚力不断增强。我院学生参加学校集体舞大赛，以一曲“黄河赞歌”取得团体一等奖。学生社团承办南京市“不让毒品进校园”集中宣传月活动启动仪式，被南京市团委授予“南京市禁毒志愿者总支队”称号。
